研究领域:Fisher博士领导牛津大学靶点发现研究所蛋白组部。他的职业专长涵盖了从基础研究项目到临床新药物靶点和市场开发等合作工作,甚至还有古蛋白组。目前Fisher博士和他的团队关注的是样品准备方法的筛选,以此来增强使用有限的临床材料进行深度蛋白组研究灵敏度和效率。
挑战:培养细胞深度蛋白组是很容易获得的。但是,从有限的生物材料-比如组织部分或某种表型的单个分离细胞(比如通过排列或激光捕获,显微切割)-中检测到>2000蛋白质还是相当困难的,而后者相当接近单细胞蛋白组。
他是如何解决这一困难:Fisher博士和他的团队使用 Purkinje神经元激光捕获显微切割,评估不同样本准备方法从少量细胞中辨识出最多蛋白的效率。蛋白微珠固定加上后续消化(SP3方法)获得的可识别蛋白数量最多,比标准溶液内消化、FASP和iST方法都要多。
好结果:SP3方法能够大约从200个Purkinje细胞中检测出>2500蛋白质。团队通过把这种方法和串联质谱标签(TMT)试剂和初步组分分离相结合,预期能够从一个样本中对不同脑细胞类型进行深度蛋白质检测和定量分析,从而在细胞精度水平上获得空间蛋白分析结果。