近年来的调查和定性反馈结果表明,研究人员对当前的cDNA合成结果并不满意,同时他们也不得不检测越来越多的困难样本,如含有抑制剂的纯化不佳RNA,或已降解的RNA。为了解困难样本反转录的效能问题,我们在多种抑制剂存在的条件下,将SSIV VILO与其他市售的cDNA合成试剂盒进行了RT效率的比较。按照以下公式,以SSIV VILO反应的Ct 值对其他供应商的试剂盒所生成的Ct 值进行归一化计算:归一化的Y值 = [1/2^(Ct SSIV VILO -Ct 供应商 x)]。如图3A所示,无论是否存在抑制剂,SSIV VILO在所有cDNA合成试剂盒中都表现出最高的反应效率。与此类似,SSIV VILO还在冷冻样本(图3B)和FFPE样本(图3C)的cDNA合成反应中实现了更高的效能。
图3A.SSIV VILO与其他8款市售预混液之间的比较。使用100 ng Hela总RNA,在20 μL RT反应体系(加入或不加指定浓度的抑制剂)中进行RT反应。在10 μL qPCR反应体系中,使用EXPRESS qPCR SuperMix和B2M基因靶点的TaqMan引物/探针评估qPCR的反应效能。
图3B.在20 μL RT反应体系中,使用50 ng冷冻组织的RNA样本进行RT反应,并对SSIV VILO与其他5款市售的预混液产品的反应效果进行比较。在10 μL qPCR反应体系中,使用EXPRESS qPCR SuperMix和基因靶向TaqMan引物/探针评估qPCR的反应性能。
图3C.在20 μL RT反应体系中使用50 ng FFPE的RNA样本进行RT反应,并对SSIV VILO与其他4款市售的预混液产品进行比较。使用EXPRESS qPCR SuperMix,以10 μL反应体系和基因靶点针对性的TaqMan引物/探针评估qPCR的反应性能。