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新品推荐:SuperScript IV VILO 预混液

发布时间: 2016-06-17

发布时间:2016-6-17

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更短时间内获得更高cDNA得率

 

InvitrogenTM SuperScriptTM IV VILOTM预混液是一款cDNA反应预混液,专为两步法定量PCR应用(RT-qPCR)而设计。该款预混液产品形式结合了优化的缓冲条件以及以高度持续合成能力和热稳定性著称的InvitrogenTM SuperScriptTM IV逆转录酶(RT),从而将成熟的VILOTM技术(可变输入,线性输出)提升至全新维度。

这一全新配方能够帮助用户实现更高的cDNA反应温度和更短的反应时间,同时提升了cDNA得率和灵敏性——即使样本的纯度不佳或模板量较低也能良好反应。

 

新品特性

一款能帮助用户提高RT-qPCR效率和可重复性的全新工具 

  • 简化的实验方案—在10分钟内实现cDNA合成,在2分钟内去除gDNA(可选)

  • 更高的得率—相比其他市面上的RT而言,Ct 值至少低2个循环以上

  • 更高的灵敏度—即便样本纯度不佳也能实现高效扩增

SuperScript IV VILO Master Mix

PK


 

 

1

灵敏度与线性度

SuperScript IV VILO预混液(SSIV VILO)包含了SuperScript IV RT,其配方经专门优化,能够为进行RT-qPCR应用的研究者同时提供便利性和高效酶的性能优势。作为一款性能卓越的逆转录酶,SuperScript IV 逆转录酶的持续合成能力相比市面上其他类型的RT酶实现了显著提升,从而能提供对低丰度靶标更高的灵敏性,对RT反应抑制剂更高的耐受性以及更快的反应时间。本预混液的配方中还包含了专利的辅助蛋白,能够在优化的缓冲环境中进一步提升RT酶与RNA模板之间的反应效果,因此SSIV VILO拥有比SuperScript VILO或其他cDNA合成试剂盒更高的效率。  

在使用较低量的RNA起始样本进行14条靶标转录本的RT-qPCR分析时,SSIV VILO实现了高于其他参加测试的市售cDNA合成试剂盒的最高反应效率(图1)。在10分钟的反应条件下,SSIV VILO的Ct 值稳定低2个循环以上。

图1.SSIV VILO与其他10款市售第一链cDNA合成预混液之间的RT-qPCR反应效率比较。根据生产商提供的使用说明,使用预混液和1 ng起始总HeLa RNA,在20 μL RT反应中合成cDNA。。对于qPCR应用而言,用户需在10 μL InvitrogenTM EXPRESS qPCR超混液(货号11785200)的反应体系中使用1 μL的RT,与Applied BiosystemsTM TaqManTM 引物和/或探针(靶向特定的基因靶标)进行反应。所显示的qPCR结果相对SSIV VILO组的倍数改变进行了归一化计算 [=1/(2^(Ct SSIV VILO – Ct 比较组))]。

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难于检测的样本

近年来的调查和定性反馈结果表明,研究人员对当前的cDNA合成结果并不满意,同时他们也不得不检测越来越多的困难样本,如含有抑制剂的纯化不佳RNA,或已降解的RNA。为了解困难样本反转录的效能问题,我们在多种抑制剂存在的条件下,将SSIV VILO与其他市售的cDNA合成试剂盒进行了RT效率的比较。按照以下公式,以SSIV VILO反应的Ct 值对其他供应商的试剂盒所生成的Ct 值进行归一化计算:归一化的Y值 = [1/2^(Ct SSIV VILO -Ct 供应商 x)]。如图3A所示,无论是否存在抑制剂,SSIV VILO在所有cDNA合成试剂盒中都表现出最高的反应效率。与此类似,SSIV VILO还在冷冻样本(图3B)和FFPE样本(图3C)的cDNA合成反应中实现了更高的效能。Figure 3A

图3A.SSIV VILO与其他8款市售预混液之间的比较。使用100 ng Hela总RNA,在20 μL RT反应体系(加入或不加指定浓度的抑制剂)中进行RT反应。在10 μL qPCR反应体系中,使用EXPRESS qPCR SuperMix和B2M基因靶点的TaqMan引物/探针评估qPCR的反应效能。Fig 3B

图3B.在20 μL RT反应体系中,使用50 ng冷冻组织的RNA样本进行RT反应,并对SSIV VILO与其他5款市售的预混液产品的反应效果进行比较。在10 μL qPCR反应体系中,使用EXPRESS qPCR SuperMix和基因靶向TaqMan引物/探针评估qPCR的反应性能。Figure 3C

图3C.在20 μL RT反应体系中使用50 ng FFPE的RNA样本进行RT反应,并对SSIV VILO与其他4款市售的预混液产品进行比较。使用EXPRESS qPCR SuperMix,以10 μL反应体系和基因靶点针对性的TaqMan引物/探针评估qPCR的反应性能。

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检测灵活性

无论您在实时荧光定量PCR反应中使用何种化学检测手段,SSIV VILO都能帮您获得最灵敏的qPCR反应效能。使用基于SYBRTM Green染料的实时PCR检测法,SSIV VILO的灵敏度在其他市售试剂盒的平均4倍以上(图4A)。类似的灵敏度也可在基于TaqMan探针的实时PCR检测中获得(图4b)。这里展示了SSIV VILO及其他两家供应商产品的 ΔCts 值(Ct 供应商),这些数值均使用SS VILO组的结果值进行归一化计算。在96个靶标中的92个(96%)上,SSIV VILO都获得了比同类产品更低的Ct值;在96个靶标中的81个(84%)上,SSIV VILO都获得了比SS VILO更低的Ct 值。这里的数据图显示了,在许多靶点上,SSIV VILO都要比包括SS VILO在内的其他供应商所提供的产品低2个Cts。Figure 4A

图4A.使用100 ng总Hela RNA样本和20 μL的RT反应体系,在SYBR RT-qPCR基因panel分析中比较SSIV VILO和其他3种市售的预混液(包括SS VILO)。在10 μL qPCR反应体系中, 使用EXPRESS qPCR SuperMix和基因靶点针对性的SYBR引物/探针评估qPCR的反应性能。Figure 4B

图4B.使用100 ng总Hela RNA样本和20 μL的RT反应体系,在TaqMan RT-qPCR基因panel分析中比较SSIV VILO和其他3种市售的预混液(包括SS VILO)。在10 μL qPCR反应体系中,使用EXPRESS qPCR 预混液和基因靶向TaqMan引物/探针评估qPCR的反应性能。
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精确定量

许多RNA分离试剂盒与分离方法无法获取完全去除了DNA的RNA样本,因此,gDNA的清除操作仍是RT-qPCR操作中的关键一步。残存的DNA会造成假阳性结果、更高的背景或较低的检测灵敏度。InvitrogenTM SuperScriptTM IV VILOTM with ezDNase预混液产品通过一个2分钟的(可选)的gDNA清除步骤,同时该产品还免去了DNA酶的热灭活或清除步骤,为用户提供了一个简化的处理流程(图5)。   InvitrogenTM ezDNase是一款双链特异性、不耐热的DNA酶,并经过基因工程处理,能够清除污染的基因组DNA,既不会影响靶标RNA的品质或数量,也不会损伤引物和探针等单链DNA。 SuperScript IV RT and competitor RT sensitivity and variability with degraded plant RNA.

图5:SuperScript IV RT与同类竞争RT产品在处理已降解植物RNA时的灵敏性与变异度比较

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